1、數據規范性、安全性
傳統的紙制單證易損毀、難保存?，F在所有數據均電子化，電子數據以其安全、便捷、易查詢、便于統計和計算的突出優點，讓日常業務的開展更為方便。即使是老員工離職，也不會出現新員工難以接替的問題。
2、提供電子化手冊的掌控渠道
加工貿易企業使用電子化手冊以后，取消了原有紙質手冊的使用，實現簡便快捷操作的同時卻缺少了對日常進出口情況記錄的實物載體，對手冊備案詳細信息、當前進出口情況得不到及時的了解。 企業在異地報關時，異地的報關公司一般會要求企業提供手冊的備案信息，以便于報關操作時進行核對。這樣就需要企業通過辦理手冊的代理公司導出手冊的備案信息。而保稅加工輔助核銷系統中詳細記錄了加工貿易企業的手冊備案信息及日常報關數據，為企業提供靈活的電子化手冊掌控渠道。
3、手冊余量自動提醒
系統會根據企業手冊的備案信息和日常的報關情況，及時計算手冊的余量，方便企業提前做好增補準備，防止出現料件超進、成品超出情況的發生，保證加工貿易貨物的正常進出口。
4、倒掛提醒 系統幫助企業提供一系列的預警提醒功能，如時間倒掛、金額倒掛、重量倒掛、退單提醒等。便于企業隨時了解手冊情況，在報核前提前查找原因并解決問題。 
5、核銷報表自動生成將核銷工作放到日常工作中來做，方便企業對保稅料件實際動態的掌控。在日常工作中維護基礎數據，將日常工作形成記錄，企業不用依賴Excel或資訊人員，各類復雜運算由系統完成，隨時生成進出口情況匯總、出口耗用合計、核銷平衡表及電子化手冊正式報核所需的基本信息、報關單、料件表、成品表、單損耗表數據，企業無需整理兩套核銷資料，將系統生成的正式報核信息提供給報關公司進行正式報核，起到數據一次維護多次使用的作用，方便企業對保稅料件實際動態的掌控。  | 
